3 Gammaproteobacterii
Între Gammaproteobacterii a fost observată o mare varietate de modele de poliamine (tabelul 3). Componentele majore pot fi DAP, PUT, CAD și SPD singure sau în combinație. În plus, pot fi prezente HPUT, HSPD și SPM. Tiparele de poliamină sunt rareori omogene în cadrul familiilor, ci adesea specifice genurilor. SPD, uneori în combinație cu o altă poliamină, este principala poliamină la speciile din familiile Oceanospirillaceae, Ectothiorhodospiraceae, Chromatiaceae, Halomonadaceae, la anumite genuri din Xanthomonadaceae și Moraxellaceae, la genurile Pseudoalteromonas, Idiomarina, Ferrimonas, la anumite specii de Thiothrix și la o singură specie din genul Shewanella. PUT este principala poliamină caracteristică la Pseudidiomarina, Legionella, la majoritatea speciilor de Shewanella și la o singură specie de Psychrobacter. Mai mulți taxoni din familiile Moraxellaceae și Pasteurellaceae conțin o singură componentă majoră DAP. Speciile de Moritella conțin predominant CAD, dar Moritella yayanosii se caracterizează prin poliamina majoră NSPD. CAD este, de asemenea, componenta principală la speciile Psychromonas, care pot conține, de asemenea, NSPD și PUT. Poliaminele majore CAD și SPD sunt caracteristice genului Alteromonas și, de asemenea, genurilor din familia Xanthomonadaceae, Stenotrophomonas și Dyella, ceea ce le deosebește în mod clar de alte genuri din această familie. Mai multe specii de Shewanella (și Colwellia maris) conțin HPUT, o diamină care este o trăsătură caracteristică pentru majoritatea Betaproteobacteriilor, dar care nu este detectată în alte neamuri bacteriene. Cu toate acestea, prezența acestei diamine nu reflectă relațiile filogenetice ale acestor specii în cadrul genului Shewanella. Speciile din familia Pseudomonadaceae conțin poliamine majore PUT și SPD și adesea și CAD. Speciile din genul Aeromonas conțin DAP și PUT ca principale componente, iar cantități semnificative de CAD pot fi, de asemenea, prezente. Speciile de Vibrio și câteva specii de Photobacterium conțin triamina rară NSPD ca o componentă predominantă. NSPD este, de asemenea, o trăsătură de diagnostic pentru genul Pasteurella sensu stricto. Speciile din acest grup conțin, de asemenea, principala poliamină PUT; prezența componentelor majore suplimentare DAP și CAD este variabilă. Alte genuri din familia Pasteurellaceae prezintă un model de poliamină fie cu DAP și SPD (Avibacterium, Mannheimia), fie cu PUT, SPD și variabil pentru DAP și CAD (Gallibacterium).
Familia Enterobacteriaceae necesită o analiză separată. Aproape toate speciile din genurile atribuite conțin diamina majoră PUT și majoritatea dintre ele conțin, de asemenea, cantități majore de DAP și/sau CAD și unele conțin și SPD. Din păcate, compozițiile diferite ale modelelor de poliamine nu reflectă decât rareori afilierea la genuri. Recent, am efectuat studii privind corelația dintre vârsta fiziologică și modelele corespunzătoare de poliamine ale unor specii selectate de Enterobacteriaceae, inclusiv Yersinia enterocolitica, Yersinia ruckeri, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii și Yokenella regenburgei (Amann, Frischmann și Busse, rezultate nepublicate). Rezultatele acestor studii au demonstrat că vârsta fiziologică a biomasei din care au fost extrase poliamine poate influența foarte mult modelul de poliamină rezultat. În celulele în fază exponențială târzie de K. pneumoniae, PUT este predominant, iar DAP este o a doua poliamină importantă. În schimb, CAD predomină în celulele din faza staționară târzie, iar PUT este o a doua poliamină majoră. Aceste modificări ale conținutului de poliamine sunt reflectate de o reducere de două ori a cantităților relative de DAP și PUT în celulele din faza staționară târzie, în timp ce cantitatea de CAD crește de 10 ori. Aplicând aceleași condiții de testare, DAP este principala poliamină din E. cloacae, iar cantitatea sa relativă nu este aproape deloc afectată (redusă de la 51% la 45%) de faza de creștere a celulelor. În același timp, CAD crește de la 2% la 22%, iar cantitățile relative de PUT nu sunt, de asemenea, afectate. În celulele în fază exponențială târzie ale Y. regensburgei, PUT este principala poliamină (54%), în timp ce în celulele staționare PUT și CAD sunt predominante (33,5±1,3%). Cantitatea relativă de DAP este stabilă atât în celulele din faza exponențială târzie, cât și în cele din faza staționară. Aceste rezultate au indicat că o parte din proporția de PUT este înlocuită de CAD în celulele din faza staționară. La C. freundii, celulele din cele două vârste fiziologice prezintă aceleași modele de poliamine cu DAP și PUT predominante și urme de CAD. La Y. enterocolitica subsp. palearctica, DAP este absent sau detectabil doar în cantități infime. PUT este principala poliamină, scăzând de la 94% în celulele din faza exponențială timpurie la 84% în celulele din faza staționară. În același timp, cantitatea relativă de CAD crește de la 3% la 14%, ceea ce indică înlocuirea parțială a PUT cu CAD. La o altă specie de Yersinia, Y. ruckeri, PUT a fost o poliamină majoră în celulele din faza exponențială timpurie, în celulele din faza exponențială medie și în celulele din faza staționară timpurie. În timpul acelorași faze de creștere, conținutul de DAP a scăzut de la 48% la 3%, în timp ce conținutul de CAD a crescut de la 6% la 58%, demonstrând o înlocuire aproape completă a DAP cu CAD. Rezultate comparabile au fost obținute, de asemenea, cu tulpini suplimentare de Y. ruckeri, demonstrând specificitatea speciei.
Aceste date demonstrează că, la speciile de Enterobacteriaceae, tiparul poliaminelor depinde în mare măsură de vârsta fiziologică a celulelor din care sunt extrase poliaminele. Un tipar de poliamină obținut din celule în fază exponențială medie poate fi clar diferit de cel al celulelor în fază staționară ale aceleiași tulpini. Prin urmare, o tulpină poate fi clasificată în grupuri diferite în funcție de vârsta fiziologică la care a fost recoltată biomasa. Analiza biomasei fără indicarea precisă a vârstei fiziologice la care sunt extrase poliaminele nu este utilă pentru clasificarea membrilor familiei Enterobacteriaceae. Majoritatea datelor privind poliamina pentru speciile din familia Enterobacteriaceae enumerate în tabelul 3 au fost obținute din articolul lui Hamana (1996). În Hamana (1996), se indică faptul că biomasa a fost colectată din celule în fază exponențială sau staționară, dar fără nicio indicație clară a vârstei fiziologice a celulelor analizate. Prin urmare, datele din Hamana (1996) nu pot servi pentru o schemă de clasificare bazată pe poliamine pentru speciile din familia Enterobacteriaceae. Trebuie efectuată o reanaliză atentă a modelelor de poliamine pe baza datelor obținute din biomasa standardizată pentru vârsta sa fiziologică pentru a demonstra valoarea acestei abordări pentru clasificarea speciilor din familia Enterobacteriaceae.
.