1,3 propandiamin

3 Gammaproteobakterier

En stor variation av polyaminmönster har observerats bland Gammaproteobakterierna (tabell 3). Huvudkomponenter kan vara DAP, PUT, CAD och SPD ensamma eller i kombination. Dessutom kan HPUT, HSPD och SPM förekomma. Polyaminmönstren är sällan homogena inom familjer utan ofta genusspecifika. SPD, ibland i kombination med ett annat polyamin, är det viktigaste polyaminet hos arter i familjerna Oceanospirillaceae, Ectothiorhodospiraceae, Chromatiaceae, Halomonadaceae, vissa släkten av Xanthomonadaceae och Moraxellaceae, släktena Pseudoalteromonas, Idiomarina, Ferrimonas, vissa arter av Thiothrix och en enda art av släktet Shewanella. PUT är det karakteristiska huvudpolyaminet hos Pseudidiomarina, Legionella, majoriteten av Shewanella-arter och en enda Psychrobacter-art. Flera taxa i familjerna Moraxellaceae och Pasteurellaceae innehåller den enda huvudkomponenten DAP. Moritella-arter innehåller huvudsakligen CAD, men Moritella yayanosii kännetecknas av den viktigaste polyaminet NSPD. CAD är också den viktigaste komponenten hos Psychromonas-arter, som också kan innehålla NSPD och PUT. De viktigaste polyaminerna CAD och SPD är karakteristiska för släktet Alteromonas och även för släktena Stenotrophomonas och Dyella i familjen Xanthomonadaceae, vilket tydligt skiljer dem från andra släkten i familjen. Flera Shewanella-arter (och Colwellia maris) innehåller HPUT, en diamin som är ett karakteristiskt drag för majoriteten av Betaproteobacteria men som inte påvisas i andra bakteriesläkten. Förekomsten av denna diamin återspeglar dock inte dessa arters fylogenetiska förhållanden inom släktet Shewanella. Arter i familjen Pseudomonadaceae innehåller de viktigaste polyaminerna PUT och SPD och ofta även CAD. Arter av släktet Aeromonas innehåller DAP och PUT som huvudkomponenter, och betydande mängder CAD kan också förekomma. Vibrio-arter och flera Photobacterium-arter innehåller den sällsynta triaminen NSPD som en dominerande komponent. NSPD är också en diagnostisk egenskap för släktet Pasteurella sensu stricto. Arter i denna grupp innehåller också det viktigaste polyaminet PUT. Förekomsten av ytterligare huvudkomponenter DAP och CAD varierar. Andra släkten inom familjen Pasteurellaceae uppvisar ett polyaminmönster antingen med DAP och SPD (Avibacterium, Mannheimia) eller PUT, SPD och varierande för DAP och CAD (Gallibacterium)

Familjen Enterobacteriaceae kräver ett separat beaktande. Nästan alla arter av de tilldelade släktena innehåller den viktigaste diaminen PUT och majoriteten av dem innehåller också stora mängder DAP och/eller CAD och vissa innehåller också SPD. Tyvärr återspeglar olika sammansättningar av polyaminmönster endast sällan släkttillhörigheter. Nyligen har vi genomfört studier om korrelationen mellan den fysiologiska åldern och motsvarande polyaminmönster hos utvalda arter av Enterobacteriaceae, inklusive Yersinia enterocolitica, Yersinia ruckeri, Klebsiella pneumoniae, Enterobacter cloacae, Citrobacter freundii och Yokenella regenburgei (Amann, Frischmann och Busse, opublicerade resultat). Resultaten från dessa studier visade att den fysiologiska åldern hos den biomassa från vilken polyaminerna extraherades i hög grad kan påverka det resulterande polyaminmönstret. I celler i sen exponentiell fas hos K. pneumoniae dominerar PUT och DAP är en andra viktig polyamin. Däremot dominerar CAD i celler i sen stationär fas och PUT är en andra viktig polyamin. Dessa förändringar i polyamininnehållet återspeglas av en tvåfaldig minskning av de relativa mängderna DAP och PUT i celler i sen stationär fas, medan mängden CAD ökar tiofaldigt. Med samma testförhållanden är DAP det viktigaste polyaminet i E. cloacae och dess relativa mängd påverkas nästan inte alls (minskad från 51 % till 45 %) av cellernas tillväxtfas. Samtidigt ökar CAD från 2 % till 22 % och de relativa mängderna av PUT påverkas inte heller. I celler i sen exponentiell fas hos Y. regensburgei är PUT det viktigaste polyaminet (54 %), medan PUT och CAD dominerar i stationära celler (33,5±1,3 %). Den relativa mängden DAP är stabil i både celler i sen exponentiell fas och i stationär fas. Dessa resultat tyder på att en del av PUT-andelen ersätts av CAD i stationära fasceller. I C. freundii uppvisar celler i de två fysiologiska åldrarna samma polyaminmönster med DAP och PUT dominerande och spår av CAD. I Y. enterocolitica subsp. palearctica saknas DAP eller kan endast påvisas i spårmängder. PUT är det viktigaste polyaminet och minskar från 94 % i celler i tidig exponentiell fas till 84 % i celler i stationär fas. Samtidigt ökar den relativa mängden CAD från 3 % till 14 %, vilket tyder på att PUT delvis ersätts av CAD. I en annan Yersinia-art, Y. ruckeri, var PUT en viktig polyamin i celler i tidig exponentiell fas, celler i mitten av exponentiell fas och celler i tidig stationär fas. Under samma tillväxtfaser minskade innehållet av DAP från 48 % till 3 %, medan innehållet av CAD ökade från 6 % till 58 %, vilket visar att DAP nästan helt ersattes av CAD. Jämförbara resultat erhölls också med ytterligare stammar av Y. ruckeri, vilket visar på artspecificitet.

Dessa data visar att i Enterobacteriaceae-arter är polyaminmönstret starkt beroende av den fysiologiska åldern hos de celler från vilka polyaminer extraheras. Ett polyaminmönster som erhålls från celler i mitten av den exponentiella fasen kan skilja sig tydligt från det som erhålls från celler i stationär fas av samma stam. Därför kan en stam klassificeras i olika grupper beroende på den fysiologiska ålder då biomassan skördades. Analyser av biomassa utan att exakt ange den fysiologiska ålder vid vilken polyaminerna utvinns är inte användbara för klassificering av medlemmar av familjen Enterobacteriaceae. Merparten av uppgifterna om polyaminer för arter i familjen Enterobacteriaceae som förtecknas i tabell 3 har hämtats från artikeln av Hamana (1996). I Hamana (1996) anges att biomassa samlades in från celler i exponentiell eller stationär fas, men utan någon tydlig uppgift om de analyserade cellernas fysiologiska ålder. Uppgifterna från Hamana (1996) kan därför inte användas för ett polyaminbaserat klassificeringssystem för arter i familjen Enterobacteriaceae. En noggrann omanalys av polyaminmönster baserat på data som erhållits från biomassa som standardiserats med avseende på dess fysiologiska ålder måste genomföras för att visa värdet av detta tillvägagångssätt för klassificering av arter i familjen Enterobacteriaceae.

Lämna ett svar

Din e-postadress kommer inte publiceras.