Kaidu mainitaan Mongolien salaisessa historiassa, Yuan shin historiassa ja Jami al-Tawarikhissa. Hän syntyi noin vuonna 1025 Menen Dutumin pojan Khachi Khulugin leskeksi jääneen vaimon, kuningatar Monolunin kahdeksasta pojasta nuorimpana. Tähän aikaan Mongolian Khitan Liao-dynastia (907-1125) hallitsi Mongoliaa, vaikka pohjoisimpia alueita oli vaikea pitää hallinnassa. Liao-dynastian khitanit hyökkäsivät 1050-luvulla Jalairin kimppuun, joka oli Darligin-mongoliheimo, joka asui Kerulenjoen varrella Mongolian kaakkoisosassa. Jalairit pakenivat Borjigin-mongolien luo, joita johti kuningatar Monolun (Salaisessa historiassa Nomulun), Khaidun äiti. He tappoivat Monolunin ja kaikki hänen poikansa lukuun ottamatta Khaidua, jonka hänen setänsä Nachin piilotti. Myöhemmin Khaidu valloitti Jalairin ja teki heistä alamaisiaan.
Rashid Al-Din sanoo Jami Al-Tawarikhissa:
Kerulenjoki on lähellä kitaanien aluetta. Khitain, Jalairin ja muiden mongoliheimojen asukkailla oli jatkuvia sotia ja yhteenottoja keskenään. Tuohon aikaan khitaneilta tuli lukuisa armeija ryöstelemään ja ryöstelemään. Kun jalairit näkivät tämän armeijan, he ajattelivat Kerulenjoen toimivan esteenä. Joen varrella oli kahluupaikka, mutta he olivat varmoja, etteivät khitanit pystyisi ylittämään jokea. Niinpä he heiluttivat pilkallisesti hattujaan ja hihojaan joen toiselta puolelta huutaen: ”Tulkaa ja ryöstäkää karjaamme!”. Koska khitanien armeijaa oli paljon, he keräsivät taitavasti kuivia oksia ja kuollutta puuta ja rakensivat yhdessä yössä padon joen ylittämistä varten. Khitanit kärsivät valtavan tappion jaalareille ja ryöstivät kaiken heidän elävän karjansa ja omaisuutensa. Kaikista jalaireista vain yksi 70 teltan ryhmä pääsi pakoon ja pakeni länteen vaimojensa ja lastensa kanssa Dutum Menenin vaimon Monolunin rajalle (epätarkka, koska hän oli itse asiassa Dutum Menenin pojan Khachi Khulugin vaimo). Koska jalairit kokivat kauheaa nälkää, he kaivoivat sudusun-nimisen kasvin juuria, joita pidettiin kyseisellä alueella syötävinä, ja söivät ne. He päätyivät jättämään Monolunin poikien hevoslaitumet kaivetuiksi ja täynnä reikiä. Monolun sanoi: ”Miksi tuhoatte ja pilaatte poikieni laitumet?”. Tämän vuoksi jalairit ottivat Monolunin kiinni ja tappoivat hänet. Hänen poikansa olivat kaikki naimisissa eri heimojen vaimojen kanssa, ja heitä oli paljon. Jalairit pelkäsivät heidän turvallisuutensa puolesta. Niinpä he väijyivät myös jokaisen hänen poikansa ja tappoivat heidät. Hänen nuorin poikansa Khaidu vietti aikaa vävynä Qanbagud-heimon keskuudessa. Sitä ennen hänen setänsä Nachin oli myös viettänyt aikaa kyseisen heimon vävynä, kuten aiemmin mainittiin (mongolit menivät naimisiin alle teini-ikäisinä ja viettivät monta vuotta vävynä). Kun Nachin sai tietää Jalairien tekemistä petoksista ja veljensä Dutum Menenin poikien kuolemasta, hän piilotti Khaidun suureen astiaan, johon mongolit valuttivat kumissia (käymistilassa olevaa tammanmaitoa), ja säilytti häntä siellä. Pian muut ympäröivät heimot, mukaan lukien eräät jalairit, kysyivät 70 telttajalairilta: ”Millä oikeudella olette tehneet näitä julmuuksia?”, ja he kaikki kukistivat heidät. Heidän vaimonsa ja lapsensa joutuivat kaikki edellä mainitun Monolunin pojan Khaidun orjiksi.”