サンフィリッポは、9歳の時に父親が経営するナッツビジネス、ジョン・B・サンフィリッポ&・サン社（以下JBSS）で働きはじめた。 1963年、父親の死後、会社の年間売上が38万3千ドルだった頃、彼は日々の経営に携わるようになりました。 その後数十年にわたり、サンフィリッポは事業を地域、そして全国規模の大手ナッツ・サプライヤーに成長させ、主にスーパーマーケット、量販店、コンビニエンスストア、フードサービス・プロバイダーにブランドおよびプライベート・ブランドのナッツと関連製品を販売しました。 サンフィリポは、全米にある同社の脱殻施設（テキサス州のピーカン、カリフォルニア州のアーモンドとクルミ、米国南西部のピーナッツ）と、イリノイ州エルジンの最終加工施設のエンジニアリングと設計・施工を主導しました。
1991年、Sanfilippoは、当時の年間売上高1億5100万ドルでナスダックに上場することに成功しました。
Sanfilippoは数十年にわたって戦略的買収を活用し、事業を成長・拡大しました。 1995年、サンフィリップとJBSSは、プロクター&ギャンブルからフィッシャー・ナッツ・ブランドを買収し、後にアメリカで最も売れているレシピナッツのブランドになりました。
2006年、24年間社長兼最高経営責任者を務めたサンフィリップは、事業の活発な経営から引退し、息子のジェフリーサンフィリップが後を引き継ぎました。